قام بتأسيس المتحف مرقص سميكة باشا عام 1910 فى عهد السلطان حسين ، وبالمتحف معلومات بثلاث لغات .. هي العربية والإنجليزية والفرنسية ويبلغ عدد المقتنيات بالمتحف القبطي حوالي 16 ألفمقتنى ، وهي مرتبة حسب الترتيب الزمني وكان المتحف القبطي تابعاً للبطريركيةالقبطية حتى عام 1931 ثم أصبح تابعاً لوزارة الثقافة ومواعيد الدخول من 9 صباحاً إلى 5 مساءً